Pod koniec lat osiemdziesiątych, Komitet Badań Naukowych (KBN) i Polska Akademia Nauk (PAN) stworzyły pierwsze w Polsce dwa krajowe programy badawcze w dziedzinie biotechnologii. Podążając za modą obowiązującą w krajach zachodnich, naukowcy z EśW zaczęli ukrywać wiele prac z zakresu inżynierii genetycznej pod bardziej strawnym dla opinii publicznej określeniem "biotechnologia". Badania te koncentrowały się na zastosowaniach w produkcji środków farmaceutycznych; tylko jeden projekt dotyczył rolnictwa, a jego celem było opracowanie testu na hybrydyzację dla wirusów ziemniaka.

Po zapoczątkowaniu w Polsce w roku 1989 przemian politycznych i gospodarczych, wszelkie fundusze na krajowe programy badawcze zostały obcięte. W roku 1991 Komitet Biotechnologii PAN zaproponował utworzenie Krajowej Agencji ds. Biotechnologii i skoncentrowanie badań na następujących zagadnieniach:

• MOLEKULARNE PODSTAWY BIOTECHNOLOGII, obejmujące badanie interakcji pomiędzy roślinami a patogenami, które mają być stosowane jako biopestycydy oraz wytwarzanie metodami inżynierii genetycznej białek, stosowanych w przemyśle chemicznym;
• BIOTECHNOLOGICZNE źRóDłA ENERGII, obejmujące badanie przetwarzania biomasy na alkohol;
• BIOTECHNOLOGIA W żYWIENIU SPOłECZEńSTWA, obejmująca badania nad kontrolą ekspresji genów wybranych roślin i zwierząt, inżynierię genetyczną komórek roślinnych i zwierzęcych oraz molekularne mechanizmy fotosyntezy;
• BIOTECHNOLOGIA DLA POTRZEB OCHRONY ZDROWIA, obejmująca badania nad fuzją komórek i technologią rybosomalnego DNA (rDNA) dla potrzeb wytwarzania leków, immunoprofilaktyki i diagnostyki.

Do roku 1992 mianem biotechnologów określało się około 1000 polskich naukowców, pracujących w około 100 zespołach. Mimo że polscy biotechnolodzy nie posiadają jednego stowarzyszenia, dość powszechnie uznaje się, że reprezentuje ich Komitet Biotechnologii PAN. W jego skład wchodzi 40 uczonych z instytutów badawczych i instytucji edukacyjnych.

W Polsce biotechnologia rozwija się obecnie głównie w rolnictwie, przemyśle spożywczym i diagnostyce weterynaryjnej i medycznej. Rząd polski, za pośrednictwem Komitetu Badań Naukowych (KBN), finansuje nowe urządzenia laboratoryjne i projekty badawcze, tworzenie sieci współpracy oraz kooperację z organizacjami międzynarodowymi, takimi jak UNESCO Network for Molecular Biology, UNIDO FACE Network i UNIDO-ICGEB. [2]